Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg3Q9CPX6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms