Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt23Q99PS0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms