Protein–RNA interactions for Protein: Q99PP9

Trim16, Tripartite motif-containing protein 16, mousemouse

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Length 556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim16Q99PP9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Trim16Q99PP9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Trim16Q99PP9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Trim16Q99PP9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Trim16Q99PP9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Trim16Q99PP9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Trim16Q99PP9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trim16Q99PP9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Trim16Q99PP9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Trim16Q99PP9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms