Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rrbp1Q99PL5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rrbp1Q99PL5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rrbp1Q99PL5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rrbp1Q99PL5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rrbp1Q99PL5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rrbp1Q99PL5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rrbp1Q99PL5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rrbp1Q99PL5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rrbp1Q99PL5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rrbp1Q99PL5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rrbp1Q99PL5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rrbp1Q99PL5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rrbp1Q99PL5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rrbp1Q99PL5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rrbp1Q99PL5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrbp1Q99PL5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrbp1Q99PL5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrbp1Q99PL5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrbp1Q99PL5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrbp1Q99PL5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrbp1Q99PL5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrbp1Q99PL5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrbp1Q99PL5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrbp1Q99PL5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrbp1Q99PL5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrbp1Q99PL5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrbp1Q99PL5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrbp1Q99PL5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms