Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rims1Q99NE5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rims1Q99NE5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rims1Q99NE5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rims1Q99NE5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rims1Q99NE5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms