Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ubqln4Q99NB8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ubqln4Q99NB8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ubqln4Q99NB8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ubqln4Q99NB8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ubqln4Q99NB8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ubqln4Q99NB8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ubqln4Q99NB8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ubqln4Q99NB8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ubqln4Q99NB8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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