Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB3

Tcam1, Cell adhesion molecule TCAM-1, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcam1Q99NB3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcam1Q99NB3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcam1Q99NB3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms