Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rnf17Q99MV7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf17Q99MV7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms