Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mccc1Q99MR8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms