Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SrrtQ99MR6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms