Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms