Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms