Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rcbtb2Q99LJ7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Rcbtb2Q99LJ7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Rcbtb2Q99LJ7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Rcbtb2Q99LJ7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rcbtb2Q99LJ7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms