Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99KU6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99KU6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99KU6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99KU6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99KU6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99KU6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99KU6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99KU6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99KU6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99KU6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99KU6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99KU6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99KU6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99KU6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99KU6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99KU6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99KU6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99KU6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99KU6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99KU6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99KU6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99KU6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99KU6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99KU6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99KU6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99KU6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99KU6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99KU6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99KU6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99KU6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q99KU6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99KU6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q99KU6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q99KU6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q99KU6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q99KU6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q99KU6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q99KU6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q99KU6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q99KU6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q99KU6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q99KU6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q99KU6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q99KU6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q99KU6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q99KU6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q99KU6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q99KU6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q99KU6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q99KU6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q99KU6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q99KU6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q99KU6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q99KU6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q99KU6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q99KU6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99KU6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99KU6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99KU6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99KU6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99KU6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99KU6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99KU6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99KU6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99KU6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99KU6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99KU6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms