Protein–RNA interactions for Protein: Q99KS2

Ngrn, Neugrin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgrnQ99KS2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NgrnQ99KS2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms