Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Clint1Q99KN9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Clint1Q99KN9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clint1Q99KN9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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