Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ciao1Q99KN2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ciao1Q99KN2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ciao1Q99KN2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ciao1Q99KN2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ciao1Q99KN2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ciao1Q99KN2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ciao1Q99KN2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ciao1Q99KN2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ciao1Q99KN2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ciao1Q99KN2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ciao1Q99KN2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ciao1Q99KN2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ciao1Q99KN2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ciao1Q99KN2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ciao1Q99KN2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ciao1Q99KN2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ciao1Q99KN2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ciao1Q99KN2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ciao1Q99KN2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ciao1Q99KN2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ciao1Q99KN2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ciao1Q99KN2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ciao1Q99KN2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ciao1Q99KN2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms