Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms