Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp11Q99K46 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms