Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms