Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR8

Smarcd2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd2Q99JR8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcd2Q99JR8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd2Q99JR8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms