Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pacsin3Q99JB8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin3Q99JB8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms