Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms