Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctu1Q99J10 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms