Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SptssbQ925E8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms