Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lmo1Q924W9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms