Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prpf3Q922U1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms