Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Clip1Q922J3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms