Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb6Q922F4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms