Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpe65Q91ZQ5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpe65Q91ZQ5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms