Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pde6cQ91ZQ1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms