Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms