Protein–RNA interactions for Protein: Q91WG3

Trub2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Trub2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub2Q91WG3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trub2Q91WG3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trub2Q91WG3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms