Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC7

Nipal2, NIPA-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipal2Q91WC7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipal2Q91WC7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipal2Q91WC7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipal2Q91WC7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipal2Q91WC7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipal2Q91WC7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipal2Q91WC7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipal2Q91WC7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipal2Q91WC7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipal2Q91WC7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipal2Q91WC7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipal2Q91WC7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipal2Q91WC7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipal2Q91WC7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipal2Q91WC7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipal2Q91WC7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipal2Q91WC7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipal2Q91WC7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms