Protein–RNA interactions for Protein: Q91W92

Cdc42ep1, Cdc42 effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep1Q91W92 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep1Q91W92 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms