Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms