Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nsmce2Q91VT1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms