Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ccdc71Q8VEG0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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