Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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