Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn4Q8VCH8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
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