Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slf1Q8R3P9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slf1Q8R3P9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms