Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmpQ8R373 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms