Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms