Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CipcQ8R0W1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms