Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3A0

Hscb, Iron-sulfur cluster co-chaperone protein HscB, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HscbQ8K3A0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HscbQ8K3A0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HscbQ8K3A0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HscbQ8K3A0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HscbQ8K3A0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HscbQ8K3A0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HscbQ8K3A0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HscbQ8K3A0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HscbQ8K3A0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HscbQ8K3A0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HscbQ8K3A0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HscbQ8K3A0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HscbQ8K3A0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HscbQ8K3A0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HscbQ8K3A0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HscbQ8K3A0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HscbQ8K3A0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HscbQ8K3A0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HscbQ8K3A0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HscbQ8K3A0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HscbQ8K3A0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HscbQ8K3A0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HscbQ8K3A0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HscbQ8K3A0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HscbQ8K3A0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HscbQ8K3A0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HscbQ8K3A0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms