Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsl1Q8K305 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsl1Q8K305 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsl1Q8K305 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsl1Q8K305 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsl1Q8K305 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsl1Q8K305 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsl1Q8K305 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsl1Q8K305 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsl1Q8K305 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsl1Q8K305 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsl1Q8K305 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsl1Q8K305 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsl1Q8K305 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsl1Q8K305 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsl1Q8K305 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsl1Q8K305 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsl1Q8K305 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsl1Q8K305 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsl1Q8K305 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms