Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf39Q8K2Z2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms