Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

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Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gtf3c1Q8K284 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gtf3c1Q8K284 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gtf3c1Q8K284 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gtf3c1Q8K284 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gtf3c1Q8K284 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf3c1Q8K284 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gtf3c1Q8K284 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gtf3c1Q8K284 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gtf3c1Q8K284 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c1Q8K284 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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