Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pacs1Q8K212 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms