Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms